环境变量管理软件environment module files

zhang1998

其实也不算我的原创，通过网上的资料整理而来，发现大家都麻烦的设置各个版本软件的环境变量，如果出现莫名其妙的问题很难知道问题到底出在哪，或者source了一个脚本发现自己需要的软件path根本不是对应的版本，有了modulefile，这样狗血的情况基本不会发生了，当然，免费软件偶尔也会有的小bug的。下面是软件英文介绍翻译过来的 软件介绍 Modules environment描述 这是一个系统允许你很容易的在各个编译器好软件版本中转换，无论你使用什么shell，每次不需要手动设置环境变量，以下是作者感言： module 模块是数据库和一系列脚本的集合，简化shell的初始化，允许用户在工作过程中很容易的修改环境变量，module模块减少unix环境变量的维护难度，提供了一种机制通过一个方式动态修改应用环境。 适应对象 suse 工作站和所有其他server除了Chimaera and Athens，插一句，旁白：在rhel6环境工作ok 源代码 http://modules.sourceforge.net/，旁白：网上可以搜到很多需要自己编译的软件版本，软件洒家也编译过，但是这个东西不是编译不了，是编译完死活也运行不起来，提示tcl无法初始化，试过各种tcl的版本，就在几乎绝望的时候为了安装方便为RHEL配置了centos的源，然后狗血的发现里面竟然有tcl，后来又在sourceforge发现了编译好的module filels，终于在一堆默认的路径下把module filels run 起来了，如果有大侠知道如何设置tcl环境那是极大的感谢。 Licence details GPL 用户手册 基本信息 机器可能有不同版本的fortran编译器，库，和其他安装的软件，其中的一部分又有很多版本，会越来越难为用户设置环境变量，特别是需要测试代码，不停的在各个版本间切换，module模块的目的是为终端用户减化该过程。 在很多机器上，module模块是统一的，有的机器上module是在用户login是加载的。旁白：.cshrc,.bashrc登场了 module filels使用以下方式工作，列出可以加载的模块 cen1001@sword:~$ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) modules              3) ifort/8.0            5) nag/5.0 2) ifc                  4) pgi/4.0-3(default) 你可以看到它加载了自己，modules，其他的基本都是编译器，旁白：洒家这里是大量的eda工具，好几好几屏。但是可能你不知道这个ifc是干啥的 cen1001@sword:~$ module whatis ifc ifc                  : Loads version 7 of the Intel Fortran compiler cen1001@sword:~$ module help ifc ----------- Module Specific Help for 'ifc' ------------------------         ifc - loads version 7 of the Intel Fortran compiler         Thisadds /usr/local/intel/compiler70/ia32/bin to the PATH and         sets the LM_LICENSE_FILE variable amongst others.         ifc is a highly optimizing Fortran compiler for Intel chips.         It relies on a licence server for compiling, but binaries may         be run without a licence being available. There is a manpage,         and both HTML and PDF documentation in         /usr/local/intel/compiler70/doc . 其中一些modules可能有不同版本，你可以看每个module的版本cen1001@sword:~$ module avail ------------------------- /usr/local/Modules/versions -------------------------- 3.1.6 --------------------- /usr/local/Modules/3.1.6/modulefiles --------------------- fftw/2.1.5/ifc      module-cvs          null fftw/3.0.1          module-info         pgi/4.0-3(default) ifc                 modules             pgi/5.0-2 ifort/8.0           mpi/mpich/1.2.5/ifc pgi/5.1-6 mkl/6.0(default)    mpi/mpich/1.2.5/pgi pgi/5.2-4 mkl/6.1             nag/5.0             use.own 如果你想看一个模块加载了什么东西cen1001@sword:~$ module display ifort ------------------------------------------------------------------- /usr/local/Modules/3.1.6/modulefiles/ifort/8.0: module-whatis    Loads version 8.0 of the Intel Fortran compiler setenv           LM_LICENSE_FILE 28518@por.ch.private.cam.ac.uk append-path      PATH /usr/local/intel_fc_80/bin prepend-path     LD_LIBRARY_PATH /usr/local/intel_fc_80/lib append-path      MANPATH /usr/local/intel_fc_80/man ------------------------------------------------------------------ 有一些module和其他的软件冲突，比如你可以有一个pgi模块load环境变量，如果我在pgi load 5.2-4之前load了4.0-3，我获得了一个编译错误的信息，这时我需要卸载 4.0-3 cen1001@sword:~$ module unload pgi cen1001@sword:~$ module load pgi/5.2-或者更省事:cen1001@sword:~$ module swap pgi pgi/5.2-4 今天翻译不完了，明天继续 有些机器有特殊的module，这些module通过一个命令加载了一系列的模块，当进行并行运算，这些运算一般需要load一系列的兼容module， 这种方法能够保证依赖关系正确有效，此时该方法很有用。这些module称为环境或者编译器，这些特殊的module类似于位于你shell中的快捷方式 ，除了load module不做其他的处理。 下面删除了一段，使你的环境更加严谨，管理员注意事项dd 加载模块 module load ifort/32/9.0/032 proc ModulesHelp { } {   puts "This is a dummy module; to see what it does type \"module disp [module-info name ]\"\n"   }   module-whatis "This is a dummy module; type \"module disp [module-info name ]\" to see what it does\n"ok，该模块已经加载到你的环境里了。 下面结合ic eda说一下： 首先，你要安装好module file，在安装modulefile之前，要先安装tcl，当然推荐使用sourceforge编译好的modules，有依赖包就去下载，原版的module不是通常情况加载到PATH路径下的，所以which module可能找不到，这时试用一下moduleava，如果安装了会有显示。modules会使用一组文件夹表明所list的软件版本，比如 <lion@hal:/home/lion> cd env/module_files/ .  ..  codelink  ius  project  specman  verdi  vipcat 在环境变量里使用module use ~/env/module_files，该module file下面的软件版本就会出现在module list里面，然后选择大家最喜欢的verdi看看里面有些什么，这里面就是实际的软件版本了 .   2006.07  2008.04  2009.01  2009.10  2010.04  2010.10  2011.10   ..  2007.07  2008.10  2009.07  2010.01  2010.07  2011.01  2012.04  2012.10 打开一个看看 #%Module1.0 # verdi and siloti 2012.10 version ###################################################################### # Set Verdi Path ###################################################################### set       verdi_home    /tools/novas/verdi-201210 setenv    VERDI_HOME    $verdi_home setenv    SILOTI_HOME   $verdi_home #set the SPS_BATCH_KILL environment variable to 1 when using the esa #utility in LSF environments setenv    SPS_BATCH_KILL 1 # FSDB set up # Enable glitch and event sequence dumping setenv NOVAS_FSDB_ENV_MAX_GLTICH_NUM 0 setenv NOVAS_FSDB_ENV_DUMP_SEQ_NUM on prepend-path    PATH            $verdi_home/bin # Add FsdbDump ##--- for NC simulator -------# prepend-path   LD_LIBRARY_PATH $verdi_home/share/PLI/IUS/LINUX64 ##--- for VCS simulator ----# prepend-path   LD_LIBRARY_PATH   $verdi_home/share/PLI/VCS/LINUX #dump fsdb on mult-core workstations setenv NOVAS_FSDB_PARALLEL 1 #internal optimization setenv FSDB_NCSIM_OPTIM 1 prepend-path NOVAS_LICENSE_FILE 28001@c0217 大概讲一下，#%Module1.0是表明该文件是module file使用的，不添加该文件版本不会出现在module list里面，下面是软件的说明，在下面就是大家熟悉的部分了，需要注意的是它有自己的语法结构，setenv的变量不能作为内部变量使用，像prepend-path是把该变量加在变量前面，当然它还有很多复杂的语法，大家需要自己研究，我也不会。 好了，写好module file之后重新module ava xx，它就会出现在list里面，然后module load，新的环境就已经加载了，但是实际上老的变量还在，最好把老的module unload。核心东西就这么多，还有很多东西大家可以探索。